Frokaj absolvierte einen grossen Teil seiner fussballerischen Ausbildung im Nachwuchs des FC Basel. Auf die Saison 2025/26 hin wechselte der vielseitig einsetzbare Mittelfeldspieler zum FC Aarau. Für die Aargauer bestritt der kosovarische U-Nationalspieler 36 Pflichtspiele, in denen er fünf Skorerpunkte sammelte. «Leon ist ein junger, talentierter, dynamischer Mittelfeldspieler mit einem guten Abschluss. Er ist vielseitig einsetzbar und gibt so unserem Trainerteam weitere Optionen», lässt sich Sportchef Roger Stilz in der Medienmitteilung zitieren.
Mittelfeldspieler Leon Frokaj wechselt von Aarau zum FC St. Gallen